Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
E130208F15RikQ3UPV3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E130208F15RikQ3UPV3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E130208F15RikQ3UPV3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms