Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms