Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrc1Q3UPH1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Prrc1Q3UPH1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms