Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Skap2Q3UND0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Skap2Q3UND0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.6 ms