Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cln5Q3UMW8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cln5Q3UMW8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cln5Q3UMW8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms