Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CrxosQ3UL53 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CrxosQ3UL53 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms