Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gpr55Q3UJF0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gpr55Q3UJF0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms