Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp19Q3UJD6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp19Q3UJD6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp19Q3UJD6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp19Q3UJD6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp19Q3UJD6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp19Q3UJD6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp19Q3UJD6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp19Q3UJD6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp19Q3UJD6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp19Q3UJD6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp19Q3UJD6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp19Q3UJD6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp19Q3UJD6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp19Q3UJD6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp19Q3UJD6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp19Q3UJD6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp19Q3UJD6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp19Q3UJD6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp19Q3UJD6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp19Q3UJD6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp19Q3UJD6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp19Q3UJD6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp19Q3UJD6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp19Q3UJD6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp19Q3UJD6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp19Q3UJD6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp19Q3UJD6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp19Q3UJD6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp19Q3UJD6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Usp19Q3UJD6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp19Q3UJD6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp19Q3UJD6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp19Q3UJD6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp19Q3UJD6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp19Q3UJD6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp19Q3UJD6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp19Q3UJD6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp19Q3UJD6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp19Q3UJD6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp19Q3UJD6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp19Q3UJD6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp19Q3UJD6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp19Q3UJD6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp19Q3UJD6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp19Q3UJD6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp19Q3UJD6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp19Q3UJD6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp19Q3UJD6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp19Q3UJD6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp19Q3UJD6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp19Q3UJD6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp19Q3UJD6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp19Q3UJD6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp19Q3UJD6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp19Q3UJD6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp19Q3UJD6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp19Q3UJD6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp19Q3UJD6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp19Q3UJD6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp19Q3UJD6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp19Q3UJD6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp19Q3UJD6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp19Q3UJD6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms