Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sf3b2Q3UJB0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sf3b2Q3UJB0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Sf3b2Q3UJB0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Sf3b2Q3UJB0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sf3b2Q3UJB0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sf3b2Q3UJB0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sf3b2Q3UJB0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sf3b2Q3UJB0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Sf3b2Q3UJB0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sf3b2Q3UJB0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sf3b2Q3UJB0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sf3b2Q3UJB0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sf3b2Q3UJB0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sf3b2Q3UJB0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sf3b2Q3UJB0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sf3b2Q3UJB0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Sf3b2Q3UJB0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sf3b2Q3UJB0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sf3b2Q3UJB0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sf3b2Q3UJB0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sf3b2Q3UJB0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sf3b2Q3UJB0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sf3b2Q3UJB0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sf3b2Q3UJB0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sf3b2Q3UJB0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Sf3b2Q3UJB0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Sf3b2Q3UJB0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sf3b2Q3UJB0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sf3b2Q3UJB0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sf3b2Q3UJB0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sf3b2Q3UJB0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sf3b2Q3UJB0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sf3b2Q3UJB0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sf3b2Q3UJB0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Sf3b2Q3UJB0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sf3b2Q3UJB0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sf3b2Q3UJB0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sf3b2Q3UJB0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sf3b2Q3UJB0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sf3b2Q3UJB0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Sf3b2Q3UJB0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sf3b2Q3UJB0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sf3b2Q3UJB0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sf3b2Q3UJB0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sf3b2Q3UJB0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sf3b2Q3UJB0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms