Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf224Q3UIW8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf224Q3UIW8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf224Q3UIW8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf224Q3UIW8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf224Q3UIW8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf224Q3UIW8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf224Q3UIW8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf224Q3UIW8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf224Q3UIW8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf224Q3UIW8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf224Q3UIW8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf224Q3UIW8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf224Q3UIW8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf224Q3UIW8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf224Q3UIW8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf224Q3UIW8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf224Q3UIW8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf224Q3UIW8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf224Q3UIW8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf224Q3UIW8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf224Q3UIW8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf224Q3UIW8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf224Q3UIW8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf224Q3UIW8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf224Q3UIW8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf224Q3UIW8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf224Q3UIW8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf224Q3UIW8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf224Q3UIW8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf224Q3UIW8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rnf224Q3UIW8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf224Q3UIW8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf224Q3UIW8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf224Q3UIW8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf224Q3UIW8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf224Q3UIW8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf224Q3UIW8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf224Q3UIW8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf224Q3UIW8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnf224Q3UIW8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf224Q3UIW8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf224Q3UIW8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf224Q3UIW8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf224Q3UIW8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf224Q3UIW8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf224Q3UIW8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnf224Q3UIW8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms