Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Greb1Q3UHK3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Greb1Q3UHK3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms