Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snx27Q3UHD6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx27Q3UHD6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1080.7 ms