Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGC7

Eif3j1, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3j1Q3UGC7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eif3j1Q3UGC7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eif3j1Q3UGC7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eif3j1Q3UGC7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eif3j1Q3UGC7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eif3j1Q3UGC7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eif3j1Q3UGC7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eif3j1Q3UGC7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eif3j1Q3UGC7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eif3j1Q3UGC7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eif3j1Q3UGC7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eif3j1Q3UGC7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eif3j1Q3UGC7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eif3j1Q3UGC7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eif3j1Q3UGC7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eif3j1Q3UGC7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eif3j1Q3UGC7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eif3j1Q3UGC7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eif3j1Q3UGC7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Eif3j1Q3UGC7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif3j1Q3UGC7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif3j1Q3UGC7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif3j1Q3UGC7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif3j1Q3UGC7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif3j1Q3UGC7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif3j1Q3UGC7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif3j1Q3UGC7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif3j1Q3UGC7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif3j1Q3UGC7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif3j1Q3UGC7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Eif3j1Q3UGC7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eif3j1Q3UGC7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eif3j1Q3UGC7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eif3j1Q3UGC7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eif3j1Q3UGC7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Eif3j1Q3UGC7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eif3j1Q3UGC7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eif3j1Q3UGC7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eif3j1Q3UGC7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eif3j1Q3UGC7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eif3j1Q3UGC7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eif3j1Q3UGC7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eif3j1Q3UGC7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eif3j1Q3UGC7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eif3j1Q3UGC7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eif3j1Q3UGC7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Eif3j1Q3UGC7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eif3j1Q3UGC7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms