Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3U595 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3U595 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q3U595 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3U595 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3U595 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3U595 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3U595 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3U595 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3U595 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3U595 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3U595 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3U595 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3U595 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3U595 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3U595 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3U595 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3U595 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3U595 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3U595 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3U595 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3U595 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3U595 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3U595 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3U595 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3U595 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3U595 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3U595 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3U595 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3U595 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3U595 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3U595 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3U595 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3U595 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U595 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U595 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U595 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U595 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U595 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U595 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U595 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U595 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U595 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U595 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U595 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U595 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U595 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U595 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3U595 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3U595 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3U595 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3U595 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3U595 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3U595 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3U595 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3U595 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3U595 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3U595 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U595 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U595 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U595 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U595 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U595 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U595 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U595 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U595 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U595 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U595 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U595 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U595 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U595 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U595 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U595 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U595 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3U595 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3U595 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3U595 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3U595 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3U595 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3U595 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3U595 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3U595 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3U595 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q3U595 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3U595 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3U595 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3U595 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3U595 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3U595 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3U595 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q3U595 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U595 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U595 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U595 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U595 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U595 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U595 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U595 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U595 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q3U595 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms