Protein–RNA interactions for Protein: Q3U410

Klhl21, Kelch-like protein 21, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl21Q3U410 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Klhl21Q3U410 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl21Q3U410 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms