Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam193bQ3U2K0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam193bQ3U2K0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam193bQ3U2K0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms