Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf149Q3U2C5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf149Q3U2C5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf149Q3U2C5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf149Q3U2C5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf149Q3U2C5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf149Q3U2C5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf149Q3U2C5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf149Q3U2C5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf149Q3U2C5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf149Q3U2C5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf149Q3U2C5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf149Q3U2C5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf149Q3U2C5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf149Q3U2C5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf149Q3U2C5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf149Q3U2C5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf149Q3U2C5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf149Q3U2C5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf149Q3U2C5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf149Q3U2C5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf149Q3U2C5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms