Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX4

Slc17a7, Vesicular glutamate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a7Q3TXX4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc17a7Q3TXX4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc17a7Q3TXX4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc17a7Q3TXX4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc17a7Q3TXX4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc17a7Q3TXX4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc17a7Q3TXX4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc17a7Q3TXX4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms