Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrc28Q3TX51 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc28Q3TX51 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms