Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVI8

Pbxip1, Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbxip1Q3TVI8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pbxip1Q3TVI8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pbxip1Q3TVI8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms