Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccndbp1Q3TVC7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccndbp1Q3TVC7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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