Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fbxw18Q3TSA9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fbxw18Q3TSA9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fbxw18Q3TSA9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fbxw18Q3TSA9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fbxw18Q3TSA9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Fbxw18Q3TSA9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Fbxw18Q3TSA9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fbxw18Q3TSA9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fbxw18Q3TSA9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fbxw18Q3TSA9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fbxw18Q3TSA9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fbxw18Q3TSA9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Fbxw18Q3TSA9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fbxw18Q3TSA9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fbxw18Q3TSA9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fbxw18Q3TSA9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fbxw18Q3TSA9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fbxw18Q3TSA9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fbxw18Q3TSA9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fbxw18Q3TSA9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fbxw18Q3TSA9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fbxw18Q3TSA9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fbxw18Q3TSA9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fbxw18Q3TSA9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fbxw18Q3TSA9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fbxw18Q3TSA9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbxw18Q3TSA9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbxw18Q3TSA9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbxw18Q3TSA9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbxw18Q3TSA9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbxw18Q3TSA9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbxw18Q3TSA9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbxw18Q3TSA9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbxw18Q3TSA9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbxw18Q3TSA9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbxw18Q3TSA9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbxw18Q3TSA9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbxw18Q3TSA9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fbxw18Q3TSA9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fbxw18Q3TSA9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fbxw18Q3TSA9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fbxw18Q3TSA9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms