Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc102aQ3TMW1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc102aQ3TMW1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc102aQ3TMW1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms