Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf3c3Q3TMP1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms