Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cwc27Q3TKY6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cwc27Q3TKY6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cwc27Q3TKY6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cwc27Q3TKY6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cwc27Q3TKY6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cwc27Q3TKY6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cwc27Q3TKY6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cwc27Q3TKY6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cwc27Q3TKY6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cwc27Q3TKY6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms