Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp39Q3TIX9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp39Q3TIX9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms