Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pde12Q3TIU4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pde12Q3TIU4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pde12Q3TIU4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pde12Q3TIU4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pde12Q3TIU4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms