Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prr27Q3SYJ2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Prr27Q3SYJ2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prr27Q3SYJ2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms