Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccbe1Q3MI99 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms