Protein–RNA interactions for Protein: Q3LAC4

Prex2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prex2Q3LAC4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Prex2Q3LAC4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Prex2Q3LAC4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Prex2Q3LAC4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Prex2Q3LAC4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Prex2Q3LAC4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Prex2Q3LAC4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Prex2Q3LAC4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Prex2Q3LAC4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Prex2Q3LAC4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Prex2Q3LAC4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Prex2Q3LAC4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Prex2Q3LAC4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Prex2Q3LAC4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Prex2Q3LAC4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Prex2Q3LAC4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Prex2Q3LAC4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Prex2Q3LAC4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Prex2Q3LAC4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Prex2Q3LAC4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Prex2Q3LAC4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Prex2Q3LAC4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Prex2Q3LAC4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Prex2Q3LAC4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Prex2Q3LAC4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Prex2Q3LAC4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Prex2Q3LAC4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Prex2Q3LAC4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Prex2Q3LAC4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Prex2Q3LAC4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Prex2Q3LAC4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Prex2Q3LAC4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Prex2Q3LAC4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Prex2Q3LAC4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Prex2Q3LAC4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Prex2Q3LAC4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Prex2Q3LAC4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Prex2Q3LAC4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Prex2Q3LAC4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Prex2Q3LAC4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Prex2Q3LAC4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Prex2Q3LAC4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Prex2Q3LAC4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Prex2Q3LAC4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Prex2Q3LAC4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Prex2Q3LAC4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Prex2Q3LAC4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Prex2Q3LAC4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Prex2Q3LAC4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Prex2Q3LAC4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Prex2Q3LAC4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Prex2Q3LAC4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Prex2Q3LAC4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Prex2Q3LAC4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Prex2Q3LAC4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Prex2Q3LAC4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Prex2Q3LAC4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Prex2Q3LAC4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Prex2Q3LAC4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Prex2Q3LAC4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Prex2Q3LAC4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Prex2Q3LAC4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Prex2Q3LAC4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Prex2Q3LAC4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Prex2Q3LAC4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Prex2Q3LAC4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Prex2Q3LAC4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Prex2Q3LAC4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Prex2Q3LAC4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Prex2Q3LAC4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Prex2Q3LAC4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Prex2Q3LAC4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Prex2Q3LAC4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Prex2Q3LAC4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Prex2Q3LAC4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Prex2Q3LAC4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Prex2Q3LAC4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Prex2Q3LAC4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Prex2Q3LAC4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Prex2Q3LAC4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Prex2Q3LAC4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Prex2Q3LAC4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Prex2Q3LAC4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Prex2Q3LAC4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Prex2Q3LAC4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Prex2Q3LAC4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Prex2Q3LAC4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Prex2Q3LAC4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Prex2Q3LAC4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Prex2Q3LAC4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Prex2Q3LAC4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Prex2Q3LAC4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Prex2Q3LAC4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Prex2Q3LAC4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Prex2Q3LAC4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Prex2Q3LAC4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Prex2Q3LAC4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Prex2Q3LAC4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Prex2Q3LAC4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Prex2Q3LAC4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms