Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtl9Q32KG4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtl9Q32KG4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtl9Q32KG4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl9Q32KG4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl9Q32KG4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl9Q32KG4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl9Q32KG4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl9Q32KG4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl9Q32KG4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl9Q32KG4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl9Q32KG4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl9Q32KG4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl9Q32KG4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl9Q32KG4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl9Q32KG4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl9Q32KG4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl9Q32KG4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl9Q32KG4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl9Q32KG4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl9Q32KG4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl9Q32KG4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl9Q32KG4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl9Q32KG4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl9Q32KG4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rtl9Q32KG4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rtl9Q32KG4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rtl9Q32KG4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtl9Q32KG4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtl9Q32KG4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rtl9Q32KG4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rtl9Q32KG4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rtl9Q32KG4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtl9Q32KG4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rtl9Q32KG4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtl9Q32KG4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtl9Q32KG4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms