Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdgfl1Q2VPR5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms