Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3X8

Phactr1, Phosphatase and actin regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr1Q2M3X8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phactr1Q2M3X8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms