Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
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Shroom4Q1W617 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
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Shroom4Q1W617 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Shroom4Q1W617 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
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Shroom4Q1W617 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
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Shroom4Q1W617 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
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Shroom4Q1W617 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
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Shroom4Q1W617 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
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Shroom4Q1W617 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Shroom4Q1W617 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
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Shroom4Q1W617 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Shroom4Q1W617 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Shroom4Q1W617 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Shroom4Q1W617 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.81
Shroom4Q1W617 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Shroom4Q1W617 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Shroom4Q1W617 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Shroom4Q1W617 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Shroom4Q1W617 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Shroom4Q1W617 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Shroom4Q1W617 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Shroom4Q1W617 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Shroom4Q1W617 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Shroom4Q1W617 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Shroom4Q1W617 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Shroom4Q1W617 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Shroom4Q1W617 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Shroom4Q1W617 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Shroom4Q1W617 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Shroom4Q1W617 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Shroom4Q1W617 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Shroom4Q1W617 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Shroom4Q1W617 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Shroom4Q1W617 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms