Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim71Q1PSW8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim71Q1PSW8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms