Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Cers3Q1A3B0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cers3Q1A3B0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cers3Q1A3B0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cers3Q1A3B0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cers3Q1A3B0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cers3Q1A3B0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cers3Q1A3B0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cers3Q1A3B0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cers3Q1A3B0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cers3Q1A3B0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cers3Q1A3B0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cers3Q1A3B0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cers3Q1A3B0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cers3Q1A3B0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cers3Q1A3B0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cers3Q1A3B0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cers3Q1A3B0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cers3Q1A3B0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cers3Q1A3B0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cers3Q1A3B0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cers3Q1A3B0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cers3Q1A3B0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cers3Q1A3B0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cers3Q1A3B0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cers3Q1A3B0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cers3Q1A3B0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cers3Q1A3B0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cers3Q1A3B0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cers3Q1A3B0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cers3Q1A3B0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cers3Q1A3B0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cers3Q1A3B0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cers3Q1A3B0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cers3Q1A3B0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cers3Q1A3B0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cers3Q1A3B0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cers3Q1A3B0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cers3Q1A3B0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cers3Q1A3B0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms