Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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Spatc1Q148B6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spatc1Q148B6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spatc1Q148B6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms