Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gli2Q0VGT2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gli2Q0VGT2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gli2Q0VGT2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gli2Q0VGT2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gli2Q0VGT2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gli2Q0VGT2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gli2Q0VGT2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gli2Q0VGT2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Gli2Q0VGT2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Gli2Q0VGT2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Gli2Q0VGT2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Gli2Q0VGT2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Gli2Q0VGT2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Gli2Q0VGT2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Gli2Q0VGT2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Gli2Q0VGT2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gli2Q0VGT2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gli2Q0VGT2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gli2Q0VGT2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gli2Q0VGT2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gli2Q0VGT2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gli2Q0VGT2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gli2Q0VGT2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gli2Q0VGT2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Gli2Q0VGT2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gli2Q0VGT2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gli2Q0VGT2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gli2Q0VGT2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gli2Q0VGT2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gli2Q0VGT2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gli2Q0VGT2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Gli2Q0VGT2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gli2Q0VGT2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gli2Q0VGT2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gli2Q0VGT2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gli2Q0VGT2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gli2Q0VGT2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gli2Q0VGT2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gli2Q0VGT2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gli2Q0VGT2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gli2Q0VGT2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gli2Q0VGT2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gli2Q0VGT2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Gli2Q0VGT2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gli2Q0VGT2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms