Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppp4r2Q0VGB7 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppp4r2Q0VGB7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppp4r2Q0VGB7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ppp4r2Q0VGB7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms