Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ttc39dQ0VF76 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Ttc39dQ0VF76 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttc39dQ0VF76 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Ttc39dQ0VF76 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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Ttc39dQ0VF76 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc39dQ0VF76 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms