Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col19a1Q0VF58 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Col19a1Q0VF58 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col19a1Q0VF58 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col19a1Q0VF58 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col19a1Q0VF58 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col19a1Q0VF58 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col19a1Q0VF58 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col19a1Q0VF58 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col19a1Q0VF58 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col19a1Q0VF58 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col19a1Q0VF58 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Col19a1Q0VF58 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col19a1Q0VF58 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col19a1Q0VF58 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col19a1Q0VF58 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col19a1Q0VF58 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Col19a1Q0VF58 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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