Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rundc1Q0VDN7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rundc1Q0VDN7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rundc1Q0VDN7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rundc1Q0VDN7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rundc1Q0VDN7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rundc1Q0VDN7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rundc1Q0VDN7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rundc1Q0VDN7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rundc1Q0VDN7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rundc1Q0VDN7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rundc1Q0VDN7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rundc1Q0VDN7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rundc1Q0VDN7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rundc1Q0VDN7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rundc1Q0VDN7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rundc1Q0VDN7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rundc1Q0VDN7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Rundc1Q0VDN7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rundc1Q0VDN7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rundc1Q0VDN7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rundc1Q0VDN7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rundc1Q0VDN7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rundc1Q0VDN7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Rundc1Q0VDN7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rundc1Q0VDN7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rundc1Q0VDN7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Rundc1Q0VDN7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rundc1Q0VDN7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rundc1Q0VDN7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rundc1Q0VDN7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rundc1Q0VDN7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rundc1Q0VDN7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rundc1Q0VDN7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rundc1Q0VDN7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rundc1Q0VDN7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rundc1Q0VDN7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rundc1Q0VDN7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rundc1Q0VDN7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rundc1Q0VDN7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Rundc1Q0VDN7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rundc1Q0VDN7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rundc1Q0VDN7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rundc1Q0VDN7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rundc1Q0VDN7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rundc1Q0VDN7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rundc1Q0VDN7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rundc1Q0VDN7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rundc1Q0VDN7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rundc1Q0VDN7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rundc1Q0VDN7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms