Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V2

Sobp, Sine oculis-binding protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SobpQ0P5V2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SobpQ0P5V2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SobpQ0P5V2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms