Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Neurl1bQ0MW30 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Neurl1bQ0MW30 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Neurl1bQ0MW30 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Neurl1bQ0MW30 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Neurl1bQ0MW30 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Neurl1bQ0MW30 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Neurl1bQ0MW30 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Neurl1bQ0MW30 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurl1bQ0MW30 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurl1bQ0MW30 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurl1bQ0MW30 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurl1bQ0MW30 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurl1bQ0MW30 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurl1bQ0MW30 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurl1bQ0MW30 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurl1bQ0MW30 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurl1bQ0MW30 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurl1bQ0MW30 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurl1bQ0MW30 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurl1bQ0MW30 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurl1bQ0MW30 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurl1bQ0MW30 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurl1bQ0MW30 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurl1bQ0MW30 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurl1bQ0MW30 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurl1bQ0MW30 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurl1bQ0MW30 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurl1bQ0MW30 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurl1bQ0MW30 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurl1bQ0MW30 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurl1bQ0MW30 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurl1bQ0MW30 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurl1bQ0MW30 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurl1bQ0MW30 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurl1bQ0MW30 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurl1bQ0MW30 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms