Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ssrp1Q08943 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssrp1Q08943 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms