Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SctQ08535 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SctQ08535 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SctQ08535 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SctQ08535 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SctQ08535 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SctQ08535 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SctQ08535 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SctQ08535 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SctQ08535 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SctQ08535 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SctQ08535 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SctQ08535 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SctQ08535 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SctQ08535 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SctQ08535 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SctQ08535 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SctQ08535 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SctQ08535 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SctQ08535 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SctQ08535 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SctQ08535 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SctQ08535 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SctQ08535 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SctQ08535 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SctQ08535 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SctQ08535 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SctQ08535 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SctQ08535 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SctQ08535 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SctQ08535 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SctQ08535 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SctQ08535 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SctQ08535 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SctQ08535 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SctQ08535 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SctQ08535 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SctQ08535 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SctQ08535 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SctQ08535 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SctQ08535 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SctQ08535 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SctQ08535 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SctQ08535 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SctQ08535 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SctQ08535 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SctQ08535 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SctQ08535 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SctQ08535 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SctQ08535 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SctQ08535 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SctQ08535 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SctQ08535 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SctQ08535 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SctQ08535 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SctQ08535 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SctQ08535 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SctQ08535 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SctQ08535 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SctQ08535 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SctQ08535 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SctQ08535 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SctQ08535 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SctQ08535 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SctQ08535 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SctQ08535 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SctQ08535 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SctQ08535 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SctQ08535 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SctQ08535 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SctQ08535 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SctQ08535 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SctQ08535 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SctQ08535 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SctQ08535 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SctQ08535 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SctQ08535 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SctQ08535 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SctQ08535 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SctQ08535 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SctQ08535 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SctQ08535 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SctQ08535 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SctQ08535 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SctQ08535 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SctQ08535 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SctQ08535 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SctQ08535 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SctQ08535 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SctQ08535 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SctQ08535 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SctQ08535 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SctQ08535 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SctQ08535 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SctQ08535 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SctQ08535 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SctQ08535 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SctQ08535 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SctQ08535 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SctQ08535 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms