Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kcnma1Q08460 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnma1Q08460 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms