Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnn1Q08091 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnn1Q08091 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms