Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrstQ06666 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrstQ06666 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SrstQ06666 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SrstQ06666 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrstQ06666 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SrstQ06666 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrstQ06666 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrstQ06666 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrstQ06666 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrstQ06666 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrstQ06666 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms