Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sox12Q04890 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sox12Q04890 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sox12Q04890 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sox12Q04890 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sox12Q04890 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sox12Q04890 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sox12Q04890 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Sox12Q04890 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Sox12Q04890 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Sox12Q04890 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Sox12Q04890 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Sox12Q04890 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sox12Q04890 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sox12Q04890 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Sox12Q04890 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sox12Q04890 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sox12Q04890 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Sox12Q04890 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Sox12Q04890 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Sox12Q04890 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sox12Q04890 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Sox12Q04890 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Sox12Q04890 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Sox12Q04890 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sox12Q04890 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sox12Q04890 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sox12Q04890 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sox12Q04890 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sox12Q04890 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sox12Q04890 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sox12Q04890 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sox12Q04890 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sox12Q04890 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sox12Q04890 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sox12Q04890 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sox12Q04890 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sox12Q04890 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sox12Q04890 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sox12Q04890 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sox12Q04890 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sox12Q04890 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sox12Q04890 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sox12Q04890 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sox12Q04890 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sox12Q04890 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sox12Q04890 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sox12Q04890 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sox12Q04890 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sox12Q04890 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sox12Q04890 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sox12Q04890 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sox12Q04890 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sox12Q04890 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sox12Q04890 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sox12Q04890 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sox12Q04890 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sox12Q04890 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sox12Q04890 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sox12Q04890 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms